Историческое голосование, однако, сопровождалось серьезными беспорядками. Накануне открытия участков в Котабато-Сити произошла перестрелка между сторонниками соперничающих политических сил: первоначально сообщалось о трех погибших и 15 раненых. В течение дня произошли новые столкновения. Кроме того, фиксировались взрывы, стрельба и другие инциденты. В городе Малусо на острове Басилан избирком обнаружил заранее заполненные бюллетени в 36 из 68 избирательных участков. В результате Котабато-Сити и Малусо были переданы под прямой контроль Центральной избирательной комиссии.
Выборы в этом регионе имеют гораздо большее значение, чем обычное региональное голосование. Бангсаморо создавался как центральный элемент попытки Манилы положить конец многолетнему вооруженному конфликту на преимущественно мусульманском юге страны. В 2014 году правительство Филиппин и крупнейшая мусульманская повстанческая организация - Исламский фронт освобождения моро (MILF) - заключили мирное соглашение. Сепаратисты отказались от требования создать независимое государство в обмен на широкую политическую и экономическую автономию. За десятилетия конфликта погибли более 120 тысяч человек, около двух миллионов были вынуждены покинуть свои дома.
В 2019 году жители юга на референдуме одобрили создание BARMM, который получил значительно больше полномочий, чем существовавшая ранее мусульманская автономия. До нынешних выборов регионом управляла переходная администрация, значительную роль в которой играли бывшие руководители MILF. Теперь замысел мирного соглашения впервые доведен до конечной точки: бывший вооруженный конфликт должен окончательно перейти из плоскости борьбы с центральным правительством в обычную парламентскую политику. Именно поэтому президент Фердинанд Маркос-младший назвал голосование "определяющим моментом" для региона и всей страны.
Впрочем, как отмечают наблюдатели, процесс еще далеко не завершен. MILF раскололся на соперничающие политические лагеря, в регионе сохраняются влиятельные семейные кланы и вооруженные группы, а разоружение бывших повстанцев не закончено: около 14 тысяч бойцов MILF еще не прошли демобилизацию.